高新企业认定作为国家一项专门针对科技型企业的扶持引导政策，通过税收优惠、人才激励、政策倾斜等方式引导企业自主创新的热情，提高科技创新能力；也是企业进行政府资质税收筹划的重要途径之一。
认定为了高新技术企业都有哪些好处呢？
1、税收减免：企业所得税由25%降为15%，减免40%；同时享受研发费用加计扣除；2、财务处理：企业亏损结转弥补年限由5年延长至10年；3、政府奖励：各级政府都出台了培育奖励政策，新认定的高新企业奖励最高达200万；4、资金项目：各级政府、行业组织对高新企业实施优惠政策和资金项目扶持；5、政策倾斜：土地、房租、工业用电、节能减排等各项扶持政策；6、上市优先：新三板上市享受绿色通道，高新企业更受投资资本的青睐；7、品牌提升：享受政府品牌背书，展现科研创新能力，招投标优势。
由于认定为了高新技术企业能够得到国家的诸多好处，因此许多的企业都想申报成为高新技术企业，但是认定为高新技术企业并不是那么简单的。仅仅是高新技术企业认定专项审计报告都能给高新技术企业申报的通过率带来一定的安全隐患。
那么审计在申报高新技术企业的时候又有哪些难处呢？
1、技术领域“难”认定。审计人员很难认定企业申报的高新技术产品或服务是否属于国家重点支持的技术领域。因为审计人员只是财务方面的专家，对于技术领域他们就是外行了。再加上受利益的驱使，高新技术申报辅导机构常常帮助企业对申报材料中涉及的高新技术产品或服务进行过度包装。这种行为让人怀疑这类辅导机构提出的专业意见的可靠性，无形当中增加了审计风险。
2、收入“难”认定。大部分进行高新技术企业认定的企业内部账务设置不规范。有的企业没有设置明细账，有的企业虽然有明细账，但与其申报的高新技术产品不匹配。而且，销售发票开具也不够规范。这些不规范因素都加大了审计人员判定企业高新技术产品或服务是否匹配的难度。最终导致了企业高新技术产品或服务收入确认的难度。
3、费用核算方法“难”统一。企业在核算研究开发费用的过程中受主观因素的影响很难做到客观化。而审计人员受客观条件的限制，很难确定企业的高新技术是处于研究阶段还是开发阶段。同样审计人员也很难确定企业资本化标准及研发费用资本化后摊销期限。
4、审计“难”深入。许多申报高新技术企业的企业在管理上缺乏规范性。在研发活动方面同样缺乏规范性。企业财务人员仅仅核算研发活动的数据，投入的比例是否符合规定。审计人员对研发活动的审计也往往停留在表面例如形式上是否规范。对于数据背后的内容如费用的真实性、完整性，审计人员往往不深入钻研，只停留在表面。
以上就是审计人员在审计高新技术企业难以判断的4大点，其实这些难点，想要申报高新技术企业都可以避免的，只需要对高新技术产品或服务实事求是，让审计人员明确的了解技术产品或服务；对于企业的内部账务问题可以聘请专业人员进行操作；对于企业核算问题可以多方面进行，尽量做到客观化或让审计人员直面的认识到这项高新技术的发展阶段。
只要企业能够让审计人员明确清晰的了解自己公司的技术，那么审计报告在高新技术企业申报中将不存在安全隐患了。
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