高新技术企业认定中企业需注意，企业纳税申报表与企业申报过程中提交的审计报告数据必须一致，否则如果视为漏洞，可能会有直接被否定风险，更严重者或有税务稽查风险。
一、企业申报高企常见问题1、知识产权技术含量不高：企业仅为了申报高企而申请软著，知识产权关联性低，甚至于软著与研发项目和产品的关键技术毫无关联。
2、科技成果与产品关联性低：一部分企业“强行转化”，知识产权跟项目和产品严重不匹配，成果与产品几乎无关联。
3、人事、财务等管理制度存有漏洞：近两年来新成立的企业财务管理方面就相对松散，造成账目混乱，使审核专家对其各项管理制度存疑，造成扣分。
4、团队缺少申报资料编写经验：对于中小企业和第一次申报的企业而言，团队缺少申报资料编写实操经验，不清楚材料具体应当怎样准备。
二、申报高企注意事项1、高企认定所需材料要准备充分
高新技术企业认定新政策丰富了认定所要递交材料，尤其明确了近3个会计年度的财务审计报告及其企业所得税纳税申报表需要递交的主要内容。
2、重视研发费用的有效归集
高新技术企业认定新政策之重视研发费用的有效归集。
3、重视知识产权的核心程度和类别
盲目申报大量地与企业核心技术不相干的专利，没法与企业核心技术和主营产品相匹配，最后只会前功尽弃。
4、留意各类报表数据的一致性
年度财务审计报告、研发费用专项审计报告、高品收入专项审计报告、年度所得税纳税申报表等申报资料，一定要保证数据一致，且逻辑关系不出现明显差异，评审中财税专家重点上述资料的真实性、合理性，并且具备一票否决权，一旦被认定为提供虚假信息，将直接造成评审不通过。
三、企业申报高企，应从哪些方面准备，提高申报成功率?01
知识产权
建议公司成立满三年Ⅱ类知识产权数量至少10件以上、Ⅰ类知识产权至少1件以上，注意知识产权数量和质量双达标。
02
科技人员
科技人员占职工总数不低于10%。①科技人员名单，尽量统计所有符合条件的科技人员，指标不要刚好过线;②科技人员必须入职缴社保或个税183天以上;③科技人员要求专业与学历。理工类，允许少量非理工科相关专业的，但工作时间、工作经验和相关职称可佐证;④研发组织架构完善合理，所设置岗位、职务清楚得当、安排合理;⑤研发项目RD表中、项目立项报告和结题报告中的参与人员一致，任务分工一致。
03
研发费用
收入在5000万以下的，占比5%以上;5000万-2亿之间的，占比4%以上;2亿以上的，占比3%。①研发项目要符合《高新技术企业认定管理工作指引》对企业研究开发活动的定义，具备一定的创新性和创造性(项目鉴定、科技计划政府立项、产学研合作、相关知识产权申请等);
②研发费用结构合理，对于不同技术领域的研发活动结构明细特征各有不同;③研发辅助账或专账规范合理，在年度审计报告、汇算清缴报告中进行披露，所披露数据保持一致。
04
高新技术产品收入
①高新产品名称、合同发票规范，检测报告与产品说明要体现所定的高新技术产品;
②高新技术产品(PS表)论述跟技术领域的相关性贴切，产品的核心技术、关键指标、竞争优势以及知识产权支撑突出，提升高新技术产品价值;③高新产品的佐证资料，除合同及发票以外，建议以第三方的产品认定、检测报告等来佐证。
最后:高新技术企业税收优惠资格有效期为三年，许多企业重视申报，忽视资格维持，从而带来潜在的税务风险。根据《高新技术企业认定管理办法》要求，“科技部、财政部、税务总局应建立随机抽查和重点检查机制，加强对各地高新技术企业认定管理工作的监督检查。”因此，企业不仅要重视认定时资料的准备，更应当注重资格维持，为期满后重新认定及后续可能面临的检查做好充分准备。
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